木叶48年10月10日夜，九尾妖狐突然出现在木叶。众忍者合力阻拦妖狐……转眼间三日已过，木叶死伤人数，至今没有定论。据估计，正式的忍者，死伤人数超过了三千。平民死伤人数是忍者的十倍以上。如此多的死伤人数，归根到底只有一个原因：妖狐出现的太突然。
混乱开始于凌晨一点钟左右，凌晨5点左右结束。前后大约持续了大约4个小时，期间死伤无数，被九尾查克拉所伤的人极难治愈，许多伤者至今没有康复，这也是死伤惨重的最大原因。被九尾所伤的人员救治起来极其困难，这三天时间里已经有不少人等不及救治，陆续丧命……
毁村之痛还在继续，战争的阴云却已然密布。一时间，遭受重创的木叶，面临着灭村之危。为保家国安宁，村内众多忍者被派往边境。
三代目强忍丧妻、丧子、丧孙之痛，挑起了维持木叶安宁的大梁。三代以五十七岁的高龄再次主导木叶的日常工作，虽精力不济，但一时间却无人能替，实属可悲。
当然这主要源自四代上位后的一系列政改。四代上位后积极为的为木叶忍者争取利益，木叶忍村就和火之国王室龃龉不断。王室为了防备木叶那是手段频出，四代当政的三年里，王室先是以各种理由削减木叶的军费，用来组建各种直属武装，不久前更是成立了守护忍者部队，猿飞家族的庶子就是十二位守护忍者的一员……
以前的实力情况，王室的举动只能算是保护自身，然木叶受此重创，情势直接逆转。此时王室的力量已经超过了木叶，如果此时王室不信任木叶，或者想趁此时机彻底掌控木叶。木叶几乎没有反抗的余地……更何况……依附于王室的忍者真的没有私心？
同时木叶还负责维护整个火之国的安全。木叶重创，他国忍村也在蠢蠢欲动，此时确实需要个中流砥柱来支撑木叶。有能力者不少，但真正合适目前状况的唯有三代目火影一人。除了三代，木叶无人可应对当前的复杂局面。
混乱后的次一日，三代正式掌管木叶大权，首先就下达了平乱的命令，一时间当夜趁乱“搞事的人”全部“失踪”。
接着又发布了一级战备的命令，各地忍者严阵以待。隶属于木叶的闲散精英忍者也被安排直接赶往前线。
忍界从未真正和平，边境的小规模战争从未消失。那些在火之国各处的闲散忍者接到命令后，就都纷纷直接赶往边界。
村子里经过强力镇压，秩序初现。但时不我待，村子里还是马上抽调人手支援前线，许多忍者连伤势都来不及处理，就已经往前线出发了。当然，几乎所有的医疗忍者也都随队出发了。
安排好边境事宜，木叶的灾后问题就成了首要问题，忍者派出了大半，也只能依靠普通人来处理后续事务了。
此次事件，真正受到伤害的，其实是新晋忍者家族和许多平民商人。
木叶虽然名义上是个村，但并不是说木叶就是个小村庄的面积和人数。
木叶大的很，单是居民区就占地数十里方圆。（清朝时期的四九城也不过，东西长7.95千米，南北宽3.1千米，面积24.49平方千米。）当然这里面大多数是居住的是普通低层忍者们的家人和平民商人。商人多数是客居于此，他们只是在这做生意，发布任务等等。
木叶空地很多，民居也多是大型家族式宅院，一般只有一、两层，人口并不是太密集。但把木叶作为一个整体来看，那就显得比较特殊了。因为木叶的主导力量，各大忍者家族的居住地并不在村子的中心。
木叶建村时间太短，民居也没有进行什么特殊规划，各个民居也只是依据先来后到的原则建立的。之间依然延续着最初的默认式划分，没有什么明文规定。
木叶的驻地是个超大型山谷，以中央大道为分界，左边的是宇智波家族的族地，右边的是千手家族的族地。北边是山壁，也就是现在的火影大楼，往南则是出谷的唯一道路。
当然，那是建村时的地域划分，随后各个忍者家族不断进驻两家的地盘就被稀释缩小，当然大家主要是居住在千手家这边，现在这里已经彻底成了各个忍者家族的共有地，在二代执政时期，就安排宇智波家族也搬迁到了这边。